昭和26年（1951年）「柔道整復師に関する学校教育による免許制度」の制定にともない、この時期にはじめて本校を含む数校の養成施設が設立されました。本校は、こうした柔道整復師教育制度の草創期に、（社）東京都柔道接骨師会創設30周年記念事業「後継者育成のための養成施設の設置」により、昭和28年（1953年）「（社）東京都柔道接骨師会付属養成所」として誕生しました。
昭和35年10月（1959年）には、文京区小石川に新校舎が竣工、名称も「（社）東京柔道接骨師会付属東京柔道整復専門学校」と改称し、その後、第7期生～第39期生、2300名余の優秀な人財を送り出しました。

※文中の「東京都柔道接骨師会」は現在の「東京都柔道整復師会」です。

柔道整復師養成の社会的ニーズの高まりを背景として、教育事業の高度化・専門化に対応する為に、昭和44年（1969年）、社団法人労働保健協会に経営が委譲され、東京柔道整復専門学校として独立した教育事業体になりました。これを契機として、柔道整復師の後継者育成という目的を継承しながらも、柔道整復師界の将来を担う人財を広く社会全般から求めることとなりました。